细胞与蛋白平台
单细胞多组学分析平台
基于 10x Genomics 及 BD Rhapsody 系统,提供高通量、高分辨率的单细胞转录组、免疫组库及表观遗传分析服务,精准揭示细胞异质性。
技术概述
单细胞测序技术能够在单个细胞水平上对基因组、转录组及表观遗传组进行高通量测序分析。与传统 Bulk 测序不同,它能有效避免大量细胞混合导致的信号平均化,精准识别稀有细胞亚群,重建细胞发育轨迹,是肿瘤微环境、免疫学及发育生物学研究的核心工具。
核心能力
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极高通量:单次运行可完成数万至数十万个细胞的捕获与建库。
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多维度分析:支持 scRNA-seq、scATAC-seq、VDJ 测序及 CITE-seq。
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高细胞存活率:优化样本解离流程,确保脆弱样本(如实体瘤)的高活性。
技术流程
1
样本准备与解离
组织消化为单细胞悬液,质控活性与浓度。
2
单细胞捕获与建库
微流控芯片进行细胞包裹、裂解及条形码标记。
3
高通量测序
基于 NovaSeq 6000 进行 PE150 测序。
4
生物信息分析
Cell Ranger 降维聚类,提供定制化高级分析报告。
适用场景
样本 / 输入要求
- 细胞悬液:浓度需达到 700-1200 cells/µL,活率 >80%。
- 实体组织:新鲜组织应放入组织保存液中,4℃ 运输,24小时内送达。
- 冻存样本:提供符合要求的冻存细胞或细胞核提取物。
交付内容
数据交付:FASTQ 原始数据、BAM 比对文件及 Feature-Barcode 表达矩阵。
分析报告:标准的 HTML 交互式分析报告,包含降维聚类图、差异表达基因及功能富集分析结果。
质量控制
从样本接收到数据交付,全流程设置了 5 个核心质控节点:
1. 样本解离前评估;2. 细胞悬液上机前质控(Countess 3);3. 文库片段及浓度分析(Agilent 2100);4. 测序数据 Q30 及 Q20 监控;5. 生信分析过滤双细胞及死细胞数据。
常见问题 (FAQ)
送样组织量一般需要多少?
对于常规实体瘤,建议提供不少于 50mg 的新鲜组织;对于穿刺样本,建议提供 2-3 针。
可以做哪种物种的单细胞测序?
目前完美支持人(Human)和小鼠(Mouse)。其他物种若有高质量的参考基因组也可进行分析。
测序深度一般推荐多少?
对于 10x Genomics 3' 转录组,建议每细胞不少于 20,000 reads。
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